События в игре: На дворе 1 сентября 1998 года. Ученики вновь прибыли в Hógwarts Academý of Wítchcraft and Wízard — Шко́ла/Акаде́мия Чароде́йства и Волшебства́ «Хо́гвартс», чтобы докончить свое обучение. Лето у всех было ужасное, так как большинство из учащихся похоронили своих друзей, близких и родных. Но жизнь  ведь продолжается, наступает новый день, новые занятия, новые интриги, новые знакомства.
Темный Лорд уничтожен, но его сторонники (в лице Пожирателей Смерти) продолжают начатое им дело дело: убивают не чистокровных волшебников, запугивают, угрожают, устраивают нападения.

Члены "Ордена Феникса" стараются  всеми силами обезвредить их, сорвать их планы, но каждый раз враг оказывается на шаг впереди, из-за чего продолжается гибель не только волшебников, но и ни о чем не подозревающих магглов.

В школе "Хогвартс", тем не менее, жизнь идет своим чередом: проходят занятия, организовываются новые дуэльные клубы и кружки, ученики посещают нововеденные занятия, ожидается дружеский визит студентов из других школ чародейства и волшебства. Однако, не стоит надеяться, что все будет так безоблачно и хорошо, пока на свободе разгуливают Пожиратели Смерти, в поисках нового вождя, под чье покровительство они смогут примкнуть. И в этом хранится еще одна тайна, которая пробуждает множество вопросов: Кто же этот новый покровитель?! Кто может быть еще ужаснее и безжалостнее Темного Лорда?! И какую сторону, на этот раз, примет Гарри Поттер, если откроются новые подробности о его происхождении?!